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筛选天然色素先要了解其来源是否清晰，包括植物来源、微生物来源等方面，不同来源的色素在稳定性、溶解性和适用范围上差异较大。了解其来源，有助于判断该色素是否符合产品定位以及配料方向。另外，天然色素依赖原来提取，如果供应不稳定，会影响生产计划。选择来源稳定、供货能力强的产品，可以为长期使用提供保障，避免因断货影响生产进度。
筛选天然色素还要明确产品想要呈现的颜色效果，不同天然色素呈现的色调差异明显，有的偏鲜亮，有的偏柔和，有的更适合浅色体系，有的更适合深色体系。只有先确定颜色目标，才能有针对性地选择合适的天然色素种类。
天然色素相较于其他类型色素，更容易受到光照、温度和存储条件影响。了解色素的稳定性，可以避免在实际应用中出现褪色或变色的问题，从而保证产品外观的一致性。有的天然色素易溶于水，有的更适合油性体系，还有的对温度和酸碱环境较为敏感。如果忽略溶解性和使用环境的匹配问题，容易出现着色不均或颜色变化的情况。因此，这是筛选时必须重点考虑的因素。
筛选天然色素需要考虑其着色能力，着色能力高的色素，用量更少即可达到理想效果，既节省成本，又更容易控制色泽，通过对比不同色素，有助于选择更具性价比的产品。还有筛选时需要确认该色素是否符合相关使用要求，确保后续应用顺利进行，避免不必要的风险。
